根：苦瓜植株苦瓜根系比較發(fā)達(dá)，側(cè)根多，主要分布在30～50公分的耕作層內(nèi)，根群分布寬達(dá)130公分以上，深30公分以上,根系喜歡潮濕，又怕雨澇。
莖：莖為蔓生，五棱，濃綠色，被茸毛。主蔓各節(jié)腋芽活動力強(qiáng)，能發(fā)生側(cè)蔓，側(cè)蔓各節(jié)腋芽又能發(fā)生副側(cè)蔓，形成比較繁茂的蔓葉系統(tǒng)。是瓜類側(cè)蔓較多、較細(xì)的一種。各節(jié)除腋芽外還有花芽和卷須，卷須單生。
葉：苦瓜為子葉出土，一般不進(jìn)行光合作用。初生葉－對，對生，盾形，綠色。以后的真葉為互生，掌狀深裂，綠色，葉背淡綠色，葉脈放射狀，具五條放射葉脈，葉長16～18公分，寬18～24公分，葉柄長9～10公分，黃綠色，柄有溝。
花：花為單性同株。植株一般先發(fā)生雄花，后發(fā)生雌花，單生。雄花花萼鐘形，萼片5片，綠色，花瓣5片，黃色。具長花柄，長10～14公分，橫徑0.1～0.2公分，綠色。雄蕊3枚，分離，具5個花藥，各彎曲近s形，互相聯(lián)合。早晨開花，以6～8時為多。雌花具5瓣，黃色，子房下位，花柄長8～14公分，橫徑0.2～0.3公分，花柄上也有－苞葉，雌蕊柱頭5～6裂。
果實(shí)：苦瓜果實(shí)為漿果，表面有許多不規(guī)則的瘤狀突起，果實(shí)的形狀有紡錘形、短圓錘形、長圓錘形等。麥皮有青綠色、綠白色與白色，成熟時黃色。達(dá)到黃熟的果實(shí)，頂部極易開裂，露出血紅色的瓜瓤，瓤肉內(nèi)包裹著種子。
種子：苦瓜的種子較大，扁平，呈龜甲狀，淡黃色，種皮較厚，表面有花紋，每果含有種子20～30粒，千粒重150～180克。每畝種植用種約200～300克。
